Appartenente ad una delle famiglie perugine di giuristi tra le più note, visto che può annoverare tra i suoi avi il celebre Baldo degli Ubaldi, Filippo Baldeschi fu tra i docenti di diritto canonico più importanti del cinquecentesco Studio di Perugia. Secondo
Ermini (1971, pp.525; 548), fu alla cattedra di canonico dal 1526 al 1569. Certamente fu promotore alla laurea di Giovan Paolo Lancellotti il 22 settembre 1546 (
Scalvanti 1899) e maestro del giureconsulto aquilano Francesco Vivio (Fosi 2013).